2025

2023

2022

2021

2020

2019

Portefølje Naturvitenskap og teknologi ikon

The research system

Portefølje Humaniora og samfunnsvitenskap ikon

Ground-breaking research

Portefølje Samisk ikon

Sámi society and culture

Portefølje Demokrati, styring og fornyelse ikon

Democracy and global development

Portefølje Velferd, kultur og samfunn ikon

Welfare, culture and society

Portefølje Helse ikon

Health

Portefølje Klima- og polarforskning ikon

Climate and environment

Portefølje Landbasert mat, miljø og bioressurser ikon

Land-based food, the environment and bioresources

Portefølje Energi, transport og lavutslipp ikon

Energy and transport

Portefølje Muliggjørende teknologier ikon

Enabling technologies

Portefølje Industri og tjenestenæringer ikon

Innovation

LTP Climate, environment and environmentally friendly energy

Climate and loss of natural diversity

Internationalization

Societal security and civil preparedness

Renewal in the public sector

Velferdstjenester

Frontpage Image

Marine icon

Petroleum og mineraler

LTP Hav ikon

Oceans and coastal areas

LTP2 Muliggjørende og industrielle teknologier ikon

Enabling and industrial technologies

Trust and community

Professional environment

High quality and accessibility

LTP Climate

Strengthened competitiveness and innovation capacity

LPT Health

 An innovative business community

LTP2 Styrket konkurransekraft og innovasjonsevne ikon

LTP2 Utvikle fagmiljøer av fremragende kvalitet

LTP2 Samfunnssikkerhet og samhørighet ikon

LTP2 Fornyelse i offentlig sektor ikon

LTP2 Klima, miljø og miljøvennlig energi ikon

LTP3 Helse

Portefolje Petroleum Ikon

Portefølje Hav ikon

Portefølje Utdanning og kompetanse ikon

Portefølje Global utvikling og internasjonale relasjoner ikon

Portefølje Livsvitenskap ikon

Forsidebilde optimalisert

project-bank-technical

Et innovativt næringsliv ikon

Muliggjørende teknologier bakgrunn

Marin bakgrunnsbilde

Marin ikon

Forsidebilde

Statistics

Prosjektbanken presenterer statistikk og informasjon om prosjekter med finansiering fra Forskningsrådet fra 2004. Statistikken er fordelt på blant annet tema, år, geografi og organisasjon. Prosjektbanken gir også detaljert informasjon om de enkelte prosjektene.

...or see the summary and other information about the projects you have selected

Forside

How the grants are distributed between organisations, counties, subject areas etc....

Here are some examples of searches you can perform in the Project Databank

Portfolios

En god beskrivelse av denne siden for søkemotoroptimalisering

All long term plan objectives

About Text Queries

No thematic area or topic related to the project

has received funding in the programme period

No popular science description is available

have received funding in the programme period

The project with project number {{project number}} was not found

Technical description

Woops, something went wrong. Please refresh the page. If the error persists, please contact us.

We could not find what you were looking for

See statistics related to this LTP objective

See projects related to this LTP objective

related to this LTP objective have received grants

has been granted to projects related to this LTP objective

has been granted to projects related to this portfolio

related to this portfolio have received grants

About Prosjektbanken

Kunnskapsdepartementet – sektorovergripende

Energidepartementet

Klima- og miljødepartementet

Nærings- og fiskeridepartementet

Kunnskapsdepartementet

Diverse

Matematikk og naturvitenskap

Oslo

LTP3 Høy kvalitet og tilgjengelighet

LTP3 Fagmiljøer og talenter

LTP3 Hav og kyst

LTP3 Marine bioressurser og havforvaltning

Instituttsektor

Portefølje Banebrytende forskning

Portefølje Klima og miljø

Portefølje Forskningssystemet

Programmer

Infrastruktur og institusjonelle tiltak

Tilskudd

Australia

Nederland

Storbritannia

Forskerprosjekt

Grunnbevilgninger

Politikk- og forvaltningsområder

Marin

Naturmangfold og miljø

Anvendt forskning

Grunnforskning

Forurensning

Forskere har lenge debattert om spesifikke endringer i måten genene våre reguleres på, kalt epigenetiske endringer eller "epimutasjoner," kan øke risikoen for kreft. Våre nylige banebrytende undersøkelser har gitt sterke bevis på at epimutasjoner faktisk er en risikofaktor for visse typer kreft.
I en studie av en stor gruppe kvinner fant vi at de som hadde epimutasjoner i BRCA1-genet, hadde mye større risiko for å utvikle trippel-negativ brystkreft og høygradig serøs eggstokkreft senere i livet. Disse epimutasjonene ser ut til å oppstå tidlig under fosterutviklingen, og fører til at det fødte barnet (og senere det voksne individet) har en mosaikk av celler i kroppen, der noen få celler bærer epimutasjonen.
Nå har vi som mål å utvide disse studiene til andre gener og andre former for kreft. For å gjøre dette vil vi analysere blodprøver fra en studie som har rekruttert over 160 000 kvinner i USA.
Hvis denne forskningen lykkes, kan den revolusjonere vår forståelse av hvordan kreft utvikler seg og føre til bedre forebyggende tiltak. Det kan også ha store implikasjoner for kreftscreeningprogrammer og genetisk veiledning for personer med høy risiko for visse typer kreft.
Alt i alt fremhever vår forskning den viktige rollen som epigenetiske endringer kan spille i kreftutvikling og understreker behovet for ytterligere undersøkelser på dette området.

Cancers result from accumulation of genetic and epigenetic alterations. The minority of cancers are due to inherited (germline) alterations that affect all cells in the body. On the other hand, the majority of cancers (>85%; sporadic cancers) are believed to occur due to localised alterations that accumulate after birth as a result of stochastic processes and/or environmental effects. Recently, in a major breakthrough work, we have provided definitive evidence that some sporadic cancers arise in adult life due to mosaic BRCA1 epimutations that occurred during the early embryonic development. BRCA1 epimutations have a surprisingly high population frequency (>5% of adult women) and hazard ratios for breast and ovarian cancer (2.4 and 1.9, respectively). Together with the findings of epimutations in other tumour suppressor genes (MGMT, MLH1, etc) this has led us to hypothesise that a substantial fraction of other sporadic cancers can be attributed to prenatal epimutations in other tumour suppressor genes.

In this project, we will use ultradeep targeted methylation sequencing for quantitative and qualitative analyses of epimutations. Evaluation of cancer risk related to epimutations will be done by studying samples from prospective biobanks (WHI) with samples from healthy women that remained cancer-free or developed different types of incident cancers years/decades after samples were taken. We will also characterise epimutations present in samples of newborn boys and girls, as well as their parents (MoBa biobank). Finally, using cryopreserved blood-derived stem-like cells from young healthy males and female breast cancer patients (in-house biobank), we will assess mutational and epimutational mosaicism at the single-cell level, generating clonal phylogeny for the methylated cells and thus providing insights on early-developmental processes that create epimutations.

Mosaic epimutations: population prevalence, mechanistic origins, and their role in cancer

Exploring Talkwall as a service

Kunstig lys om natten (ALAN) setter naturen ut av balanse. Mange dyr er avhengige av lengden på dagslyset (fotoperioden) som signal for å synkronisere reproduksjon med gunstige forhold. Forstyrrelser i dette naturlige signalet, enten gjennom lysforurensning fra urban belysning eller akvakultur, kan ha alvorlige konsekvenser for dyrs livssyklus og overlevelse. Prosjektet mitt tar sikte på å avdekke de biologiske mekanismene bak sesongmessig reproduksjon for bedre å forutsi og redusere disse påvirkningene. Jeg vil undersøke et nøkkelhormon, thyroidstimulerende hormon (TSH), og dets funksjon i reguleringen av sesongmessig reproduksjon hos dyr ved å bruke medaka (japansk risfisk) som modell.
Denne lille fisken er perfekt for genetiske studier, da det allerede finnes mange verktøy og protokoller for denne arten for å studere i detalj de cellulære og molekylære mekanismene som er involvert i essensielle kroppsfunksjoner, som for eksempel reproduksjon. For å undersøke dette vil jeg bruke avanserte genetiske verktøy og optogenetikk, en metode som bruker lys til å kontrollere celleaktivitet, for å avdekke mekanismen som regulerer det sesongmessige tidspunktet for reproduksjon. Ved å dekode hvordan dyr tilpasser sin sesongmessige reproduksjon til forstyrrelser i lyssignaler, vil dette prosjektet belyse hvordan vi kan ivareta biologisk mangfold og utvikle bærekraftig akvakulturpraksis.

Seasonal reproduction in vertebrates ensures offspring survival by aligning reproductive timing with photoperiod as the primary cue. However, artificial light at night (ALAN) disrupts these cues, posing a threat to species survival. Similarly, continuous light used in aquaculture to inhibit fish reproduction may have unintended physiological effects. OptoSeason seeks to decode the mechanisms underlying seasonal reproduction as a critical step toward predicting and mitigating the impact of these environmental disturbances.
Research in mammals and birds suggests that thyroid-stimulating hormone (TSH) in the pituitary pars tuberalis (PT-TSH) regulates seasonal reproduction. However, the role of PT-TSH remains controversial due to the challenges of knocking out the Tshb gene without affecting essential thyroid functions. Thanks to the teleost-specific whole-genome duplication (WGD), we can now study a TSH gene specifically involved in seasonal reproduction using teleost fish models. Our previous findings indicate that tshbb plays a crucial role in this process.
To unravel these mechanisms, OptoSeason will develop a next-gen optogenetic tool in Japanese medaka, a seasonally breeding teleost suitable for genetic manipulation and knockout studies. Considering its potential, this tool also has broader applications across various biological research areas. We will also employ advanced techniques such as CRISPR/Cas9-mediated knockout/knock-in, receptor assays, laser microdissection, transcriptomics, calcium imaging, and patch clamping to explore the tshbb pathway and its link to reproduction.
Understanding this pathway will help identify markers for out-of-season spawning risks due to ALAN and provide insights into environmental and genetic influences on reproduction. This research will address challenges like early puberty in aquaculture, advance scientific knowledge, and develop tools to tackle key environmental and industrial issues.

OptoSeason: decoding seasonal reproduction in vertebrates using a next-gen optogenetic tool

Cøliaki er en sykdom som rammer 1-2% av befolkningen. Den eneste eksisterende behandlingen for sykdommen i dag er en livslang glutenfri kost. Det er ønskelig å utvikle alternative behandlingsmetoder. Nyere forskning har avdekket at enzymet transglutaminase 2 spiller en sentral rolle i utviklingen av sykdommen. Dette enzymet forandrer glutenproteiner slik at immunsystemet hos cøliakere kan reagerer på disse proteinene. Denne immunresponsen hos cøliakere involverer B-celler. B-celler produserer antistoffer, og cøliakere har B-celler og antistoffer som er rettet mot transglutaminase 2. I projektet ønsker vi å ta denne kunnskapen i retning mot utvikling av nye behandlingsprinsipper. En del av prosjektet dreier seg om hemming av enzymaktiviteten til transglutaminase 2, og å avdekke hvor i kroppen hvor transglutaminaseaktiviteten bør hemmes. En annen del av prosjektet dreier seg om å finne en metode som kan elimimere B-cellene som gjenkjenner transglutaminase 2.  Prosjektet vil studere celler og vev fra cøliakere samt mus som er genetisk modifisert til å uttrykke reseptorer som brukes av cøliakere til å gjenkjenne gluten og transglutaminase 2.

Celiac disease is a prevalent autoinflammatory condition caused by immune reaction to dietary gluten proteins. The only available treatment is lifelong avoidance of dietary gluten. However, symptoms and enteropathy often persist in patients who attempt to adhere to a gluten-free diet. Thus, there is a need to develop non-dietary therapies for celiac disease. 

The enzyme transglutaminase 2 (TG2) has critical roles in celiac disease pathogenesis. The enzymatic activity of TG2 creates by deamidation gluten peptides that have high affinity for disease-predisposing HLA-molecules, and these deamidated peptides are recognized by the disease-driving CD4+ T cells. Moreover, TG2 is the target of a highly specific autoantibody response. In this project we will explore two novel treatment avenues focused on TG2. In the first approach, we seek to develop novel immunotherapeutic molecules, Bispecific AutoAntigen T-cell Engagers (BiAATEs), to specifically eliminate the subset of autoreactive TG2-specific B cells while avoiding general immunosuppression. The results will be important not only for celiac disease but also for other autoimmune diseases having cytosolic autoantigens.

Second, we will explore therapeutic inhibition of TG2. ZED1227, an irreversible inhibitor of TG2, was recently shown in a phase 2 clinical trial to prevent gluten-induced intestinal damage in celiac disease patients. It is however unknown where in the body the drug is active. Our group has obtained evidence that the gut lumen likely is the relevant site where TG2 is active and encounters gluten peptides for deamidation. We will test the new hypothesis that TG2 in gut lumen is pathogenic in celiac disease and will explore inhibition of gut luminal TG2 as therapy.  

Both arms of the project will combine studies on patient samples with mechanistic experiments in state-of-the art humanized mouse models that we recently developed.

Exploring novel therapies for celiac disease centered around the autoantigen transglutaminase 2

In-Network Intelligence and Technologies

I møte med utfordringene ved en aldrende befolkning i Europa, utvikler dette prosjektet bærekraftige øyedråper basert på hydrogeler utvunnet fra plantebaserte forbindelser, for å motvirke aldersrelaterte forandringer i netthinnen.

De bio-baserte hydrogelene er utviklet for å fjerne skadelige avleiringer, redusere betennelsestilstander og forbedre oksygentilførselen til netthinnen – faktorer som er sentrale for å bevare synet og opprettholde cellenes energiomsetning.

I motsetning til eksisterende behandlinger benytter denne tilnærmingen miljøvennlige materialer og unngår invasive prosedyrer, noe som gir en tryggere og mer tilgjengelig løsning for personer med aldersrelaterte øyesykdommer.

Sustainable self-cleaning hydrogels in ophthalmology

Dette prosjektet har som mål å undersøke nervedannelse i primær brystkreft og hjernemetastaser fra brystkreft. Vår hypotese er at en undergruppe av aggressive brystkreftsvulster involverer nervestrukturer for å fremme tumorprogresjon, inkludert metastaser til hjernevev, som er den mest nevrogene nisjen i kroppen.

Hos kvinner er brystkreft den hyppigste kreftsykdommen og den ledende årsaken til kreftrelaterte dødsfall verden over. Trippel-negativ eller basaloid brystkreft er de mest utfordrende subgruppene, på grunn av mangel på effektive behandlingsmål. Studier av nervefiber-tetthet i brystkreft har vist at høyt innerverte svulster er mer aggressive, og tilstedeværelse av nerve-elementer er assosiert med økt metastasering og forverret pasientprognose. Våre foreløpige data, fra vevsanalyse av to brystkreftserier, bekrefter disse funnene. Vi anser derfor nerveinvolvering som en ny og lovende biomarkør i vår forståelse av aggressiv brystkreft.

Nerver er små fiber-strukturer i svulster, som nåler i en høystakk, og vanskelig å oppdage ved vanlig mikroskopisk undersøkelse. Derfor eksisterer det ikke automatiserte prosedyrer for deteksjon av slike svulst-nerver, og nervene sin klinisk-patologiske betydning er lite kjent. I dette prosjektet vil vi utvikle mer sensitive metoder for å påvise små nerveelementer i vev fra svulster, ved hjelp av avansert bildeteknologi. Interaksjon mellom kreftceller og nerver vil bli analysert i funksjonelle studier.

Vår hypotese er at aggressive brystkreftceller utrykker hittil ukjente markører som kontrollerer tiltrekning av nerver til primærsvulsten, og at denne tiltrekningen forårsaker endringer i en undergruppe av brystkreftceller som fremmer spredning til hjernen.

Recent data indicate that nerves might play an active role in the initiation and progress of cancer. In the breast, research by us and others has demonstrated that enhanced innervation is associated with more aggressive tumors, such as the triple negative subtype (TNBC) supporting the formation of a neurogenic niche in primary tumors. However, the detailed clinical relevance of this phenomenon, and the mechanisms by which nerves are attracted to breast tumors and how breast cancer-nerve interaction promotes aggressive tumor features, remain unexplored. Moreover, we lack good experimental models for breast cancer innervation in a human setting. 

TNBCs with a basal-like phenotype are also prone to metastasize to the brain, the most neurogenic niche in the body, but the preference for the brain as a metastatic site is not understood, neither are the phenotypic alterations that breast cancer cells undergo in brain tissue. Here, we launch a new concept - epithelial-to-neural transition (ENT) – linking cancer cell plasticity and nerve involvement in primary and brain metastatic breast cancer. We suggest that aggressive breast cancer cells express yet unknown markers that control attraction of nerves at the primary site, and that some breast cancer cells even transform by acquiring neural-like properties and spread to the brain. Epithelial-to-neural transition will be investigated both clinically and experimentally in primary and brain metastatic breast cancer by combining large clinical cohorts, spatial omics technology, and stem cell methods to establish cutting-edge models. 

This project has the potential to change the way we view neural elements in breast cancer and provide the field with new clinical relevance, models and technologies to study them.

When breast cancer hits a nerve
- Neural involvement as a hallmark of tumor progression

Antibiotikaresistens er i ferd med å bli en alvorlig global helsetrussel. Etter hvert som bakterier utvikler motstand mot dagens medisiner, blir infeksjoner som tidligere var enkle å behandle, igjen livstruende. 
Verdens helseorganisasjon (WHO) har laget en liste over farlige bakterier hvor behovet for nye antibiotika er akutt. Dessverre er de fleste antibiotika som utvikles i dag bare små endringer av gamle medisiner – og bakteriene lærer raskt å stå imot disse også.

For å løse dette problemet må vi finne helt nye måter å angripe bakteriene på. Det betyr at vi må oppdage nye angrepsmål i bakteriene og utvikle antibiotika som kan nå frem til og slå ut disse.

Dette prosjektet har som mål å gjøre nettopp det. Et internasjonalt team av forskere samarbeider for å:

Undersøke to spesifikke bakterieenzymer for å se om de kan være gode angrepsmål for fremtidige antibiotika.
Bidra til å øke vår forståelse av hvordan antibiotiske legemidler kommer seg inn i bakteier, noe som er en av de største utfordringene i utviklingen av nye antibiotika.
Vi fokuserer på tre typer skadelige bakterier: Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli og Klebsiella pneumoniae. Disse er alle såkalte «Gram-negative» bakterier, som er spesielt vanskelige å behandle på grunn av deres oppbygning.

I prosjektet vil vi studere to viktige enzymer som disse bakteriene bruker til å lage fettsyrer – molekyler de trenger for å overleve. Ved bruk av ulike teknikker skal vi designe og teste nye inhibitorer som kan blokkere disse enzymene. Samtidig skal vi undersøke hvordan disse inhibitorene kommer seg inn i bakteriene, slik at vi er sikre på at de faktisk når frem til målet sitt.

Ved å kombinere kjemi, biologi og legemiddeldesign vil dette prosjektet ikke bare hjelpe oss med å komme videre på veien til å finne nye antibiotika – det vil også gi verdifull innsikt i hvordan vi kan utvikle bedre antibiotika i fremtiden.

There is an urgent need for new antibiotics to prevent the looming crisis of antimicrobial resistance and WHO has published a list of bacteria for which antibiotics are in high demand and urged that research and drug discovery efforts are directed toward these. Antibiotics are a prerequisite for modern medicine, however, most of the compounds in clinical development are not fit for purpose at they are derivatives of already known antibiotics and therefore have cross-resistance with existing agents.
To tackle this crisis, we need fundamental knowledge on new targets for antibiotics, and we need compounds that can get into bacteria and work on these targets. This project will address this 1) by delivering potent inhibitors on two proposed bacterial protein targets to establish if they are promising targets for future antibiotics and 2) by establishing relationships between compound properties and uptake in bacteria. To reach these highly ambitious goals, we have assembled an interdisciplinary and international team of experts in antibiotic drug discovery, protein dynamics, structure-based drug design, covalent enzyme inhibition, organic synthesis and medicinal chemistry. We will explore two essential enzymes involved in fatty acid synthesis in Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, and Klebsiella pneumoniae, Gram-negative bacteria for which WHO has stated that new antibiotics are critically needed. We will use a structure-based approach to develop potent inhibitors for chemical target validation. This process will be guided by experimental data about uptake into bacteria to ensure that our compounds reach their targets, a critical step in chemical target validation. Through this we will provide crucial information to advance our understanding of the compound properties that governs uptake in Gram-negative bacteria. This will deliver far-reaching insights, not only for the studied target but antibiotic drug discovery in general.

Validating fatty acid synthesis enzymes as targets for antibiotics against Pseudomonas aeruginosa and other Gram-negative bacteria.

WebData vil tilrettelegge for forskning på data fra det norske internett, tilsvarende tjenester som Nettbiblioteket og DH-lab fra Nasjonalbiblioteket for fysisk materiale. WebData vil altså gi forskere adgang til data som ikke er tilgjengelige i en infrastruktur i dag, men som det er et stort behov for.

Nasjonalbiblioteket har hentet og lagret data fra det norske internett siden slutten av 1990-tallet og sitter på enorme mengder med data. Dette materialet har man i liten grad kunnet tilgjengeliggjøre, blant annet fordi lovverket setter strenge krav til håndtering av personopplysninger i slike arkiver. Samtidig har den offentlige samtalen for en stor del flyttet seg til nettet, slik at det er blitt viktigere å kunne forske på data fra denne delen av offentligheten. I tillegg spiller data fra nettet en særlig rolle i arbeidet med kunstig intelligens og store språkmodeller. Skal norsk og samisk overleve i den digitale tidsalderen, trenger vi så mye data som mulig av høy kvalitet for å støtte opp under språkteknologi.

WebData skal derfor bygge en plattform for forskning på materiale fra nettet i tråd med gjeldende lovverk. Det vil gis åpen tilgang til materiale publisert av det offentlige og adgang for forskningsformål til materiale utgitt med og uten ansvarlig redaktør. Vi vil ta i bruk kunnskap om og verktøy for identifisering og vasking av personopplysninger for å klassifisere materiale og bygge et system for sikker tilgang.

Plattformen skal utvikles i tett samarbeid med forskersamfunnet. Vi vil gjennomføre en behovsstudie tidlig i prosjektet for å kartlegge hvilken funksjonalitet forskerne trenger (f.eks. visualisering av ordbruk over tid, uttrekk og analyse av hendelser) som igjen vil legge føringer for tilrettelegging av data. Prosjektet har som mål å styrke samiske språks representasjon. Vi vil gjennomføre en representasjonsstudie for å undersøke hvor godt samisk er dekket i nettarkivet og gjøre tiltak for å forbedre høstingen av samiskspråklig innhold.

The National Library of Norway, a major cultural heritage institution in Norway, joins forces with some of the most prominent research communities for language technology in Norway to create WebData, a national research infrastructure for web data. WebData will offer researchers access to the Norwegian Web Archive, hosted on-premises at the National Library of Norway. The infrastructure will first and foremost consist of a data platform featuring a general purpose search interface for web data from the Norwegian web (the .no top-level domain) from the last 25 years, allowing researchers to search and explore web pages, documents, transcribed audio/video and images.

The platform will implement a model of layered access, using automatic categorization and identification of personal information to open parts of the collection that would otherwise be closed due to regulatory policies, which is a major R&D challenge and one of the main reasons why the material is not available today. The web archive will further be scaled up according to the needs of researchers and underrepresented communities, e.g. allowing for quantitative analysis of web data and by increasing the coverage of Sámi web content. The infrastructure will contribute to research on Norwegian and Sámi language and culture and produce language resources, e.g. corpora for large language models, that help prevent domain-loss of these languages.

The project is highly interdisciplinary and aims primarily at researchers in the social sciences and humanities, but will also be relevant for e.g. computer science, medicine and law.

Norwegian research infrastructure for web data

Kreftvev inneholder ikke bare kreftceller, men også en rekke forskjellige immunceller. Noen av dem er nyttige, andre bytter side og hjelper nå svulsten. Kunnskapen om fordelingen av immuncelletyper til en pasient er svært viktig. Denne informasjonen er med på å definere den beste personlige behandlingen, gi en klarere overlevelsesprognose eller hjelper å definere nye mulige behandlingsalternativer. 
I tillegg gjennomgår immunceller i tumormikromiljøet flere endringer, noen er nyttige i kampen mot kreft, andre hjelper svulsten til å vokse eller spre seg. Kunnskapen om disse endringene i de ulike immuncelletypene hjelper til med å forklare prosessene i svulsten eller til å oppdage mulige nye biomarkører for behandlingsalternativer. 
I dette prosjektet ønsker vi å ta hensyn til både den romlige fordelingen og endringene av de forskjellige immuncelletypene avhengig av deres lokalisering i forhold til kreftvev. Hvilke endringer kan vi finne? Hvordan påvirker de hverandre og hvordan påvirkes de av svulsten? Vi ønsker å bruke denne kunnskapen til å oppdage nye mulige biomarkører for behandlingsalternativer.

Spatial transcriptomics provides unprecedented details about the molecular mechanisms that take place within and between cells. ST assesses the molecular content of well-defined regions in a tissue which potentially cover contributions from multiple cells. In order to draw correct biological conclusions from ST analysis, spatial distributions of individual cell types are a prerequisite. This generates an urgent need for computational methods addressing this question. However, computational estimates of cellular compositions from ST are complicated by several factors. First, the methods require well curated data which is usually not available; every specimen has its own individual characteristics and so, every tissue type or even every patient, might require a own, comprehensively verified model. Second, data is noisy, making estimates prone to errors. Moreover, even if a computational model is designed for a specific tissue or even patient, it might be miss-specified, leading to additional systematic errors. In this project, we will develop a toolbox called Computational Dissection of Cellular Distributions (CDCD), which directly accounts for these issues. CDCD will advance the state of the art by (1) taking into account a priori unknown, hidden cellular background contributions, (2) taking into account environmental factors (i.e., tissue and patient dependence), and by (3) comprehensive errors estimation. Intriguingly, in contrast to available techniques, CDCD will facilitate estimates of cellular regulation in space! Such gene-regulation gradients will allow us to address questions of how immune cells adapt their molecular phenotype with respect to their environment. Additionally we will verify our algorithms on a conjoint norwegian phase II melanoma case study. CDCD will be made freely available via easy-to-use webpage and software solution, enabling both expert bioinformaticians and wet-lab biologists an efficient use of the to-be-developed methodology.

Computational dissection of cellular distributions and cell-type specific regulation patterns from spatial transcriptomics data

Midlene fra SVALBARDSF-SVALBARDSF fordelt på år

Midlene fra SVALBARDSF-SVALBARDSF fordelt på fylker

Midlene fra SVALBARDSF-SVALBARDSF fordelt på fagområde

Professor

The sliding of ice across its base dominates the transfer of water locked in glaciers and ice sheets to the ocean, considerably contributing to ongoing and future sea level rise. However, processes at the base of glaciers are still insufficiently understood due to challenges in accessing and reliably observing these environments.
SLIDE will generate synergies by exploiting complementary instrument designs and competences of several research groups and develop a new multi-sensor probe to sense conditions at the base of glaciers and ice sheets. 
Our novel device combines two existing technologies, namely a newly developed digital version of the well-established ploughmeter and the CryoEgg to form a wireless multi-sensor probe for measuring subglacial hydro-mechanical conditions. This will extend the scope of the instrument towards applicability for ice sheet scales. 
The project will use Kongsvegen glacier on Svalbard as a unique glacier laboratory to conduct a full-scale proof-of-concept study for the new device. The activity will benefit from the unique accessibility of Svalbard glaciers as well as the available research infrastructure and ongoing research activities and further develop the comprehensive background knowledge that has been acquired over decades.
After assembling the novel device, a borehole will be drilled to the base of Kongsvegen to deploy the instrument at the base of the glacier and transmit its measurements to a receiver station at the glacier surface. This will represent a prototype test for a new generation of borehole instruments for use on thick glaciers and ice sheets.  
To disseminate the results and exchange the gained experiences with other actors in the field, SLIDE will organize a subglacial instrumentation workshop.

Subglacial multi-sensor probe development

Produksjon og bruk av plast- og gummiprodukter har ført til økende mengder avfall i miljøet, der disse materialene brytes ned til mindre partikler over tid. Selv om problemet med plastavfall er godt kjent, er det mindre kunnskap om effektene av de kjemiske tilsetningsstoffene som brukes i disse materialene, og som kan lekke ut og påvirke marine organismer. Dette doktorgradsprosjektet fokuserte på å forstå hvordan gummibaserte mikroplastpartikler og deres tilhørende kjemikalier påvirker livet i havet, med blåskjell (Mytilus edulis) som modellsystem.
Den første delen av prosjektet utviklet nye metoder for å studere hvordan små plastpartikler samhandler med blåskjellenes immunceller (hemocytter). Ved bruk av strømningscytometri, en rask og sensitiv teknikk, ble endringer i cellehelsen målt etter eksponering for nanoplast. Resultatene viste at selv kortvarig eksponering kunne skade immuncellene og påvirke deres overlevelse og normale funksjon. Prosjektet gikk deretter videre til å studere vanlige forbrukerprodukter laget av gummi og plast, som bildekk, ballonger, skosåler og oppvaskhansker. Disse materialene viste seg å slippe ut kjemiske blandinger i sjøvann, som ga tydelige negative effekter på blåskjellceller, selv ved lave konsentrasjoner. Produkter laget av gummimaterialer hadde mer skadelige effekter enn plastflasker, noe som reflekterte det høyere innholdet av farlige kjemikalier i gummibasert avrenning. For å bedre forstå om det var partiklene i seg selv eller de kjemikaliene de frigir som forårsaker skade, ble blåskjell eksponert separat for bildekkpartikler, deres kjemiske avrenninger, og partikler som allerede hadde lekket sine kjemikalier. Resultatene viste at kjemiske tilsetningsstoffer var hovedårsaken til toksisitet, men at partiklene spilte en viktig rolle ved å fungere som langsiktige bærere av kjemikalier, som gradvis ble frigitt inne i blåskjellene over tid. Denne forlengede eksponeringen kan føre til mer varige biologiske skader og til slutt forstyrrelser i marine økosystemer.
Kort oppsummert demonstrerte prosjektet at kjemiske tilsetningsstoffer i plast- og gummiprodukter utgjør en betydelig risiko for marine organismer, og at fysiske partikler kan forsterke og forlenge disse effektene. Resultatene fremhever viktigheten av å vurdere både kjemikaliene og partiklene når miljøpåvirkningen av plastforurensning skal vurderes. Ved å utvikle nye verktøy for å måle cellulære effekter og ved å levere detaljerte kjemiske og biologiske data, har prosjektet bidratt med viktig ny kunnskap som kan støtte fremtidige risikovurderinger og reguleringer knyttet til plast- og gummiforurensning. Funnene bidrar også til å øke bevisstheten om den mindre synlige, kjemiske siden av plastforurensning, og oppfordrer til bedre produktdesign og sterkere tiltak for å beskytte miljøet.

Stipendiatstilling 1 NIVA (2020-2023)

Den økende mengden mikroplast som følge av fragmentering og nedbrytning av marint avfall er godt dokumentert, men de miljømessige risikoene knyttet til plast-assosierte kjemikalier er mindre forstått, spesielt siden de kan frigjøres sakte over lange tidsperioder. MicroLEACH-prosjektet hadde som mål å undersøke de langsiktige effektene av mikroplast og deres tilsetningsstoffer på marine arter funnet i norsk miljø. Femti termoplast- og elastomerprodukter, som representerer ulike polymerer og et bredt spekter av kjemiske tilsetningsprofiler, ble valgt ut og karakterisert. En ikke-målrettet kjemisk screening identifiserte antall og mengde plast-assosierte kjemikalier i hvert produkt, mens grunnleggende toksisitet av metanolekstrakter ble vurdert ved bruk av Bakteriell Luminescens Toksisitetstest og Algevekst Inhiberingstest. Generelt viste produkter med et høyere antall kjemikalier høyere toksisitet, der elastomerbaserte produkter hadde noen av de høyeste nivåene av tilsetningsstoffer og toksisitet. Sammenlignet med termoplaster kan kjemikalier knyttet til elastomerbaserte forbrukerprodukter dermed i større grad bidra til kjemisk utlekking i det akvatiske miljøet og utgjøre en høyere miljømessig risiko. En vurdering av hvordan miljøparametere påvirker utlekking viste en kompleks samhandling mellom egenskapene til kjemikaliene, polymermatrisen og eksterne miljøforhold. Basert på disse resultatene ble det foreslått anbefalinger for gjennomføring av utlekkingsstudier som er relevante for risikovurdering i realistiske akvatiske miljøscenarier.

Fem forbrukerprodukter med høy grunnleggende toksisitet ble valgt for mer omfattende toksisitetstesting ved bruk av nøye forberedte vannbaserte utlekkingsløsninger. Disse inkluderte bildekkgummi (CTR), ballonger (BL), oppvaskhansker (WG), laboratoriehansker (LG) og skosåler (SS). Ett produkt uten grunnleggende toksisitet (polyetylentereftalat-vannflaske, PET) ble også inkludert. Toksisitetstester ble utført på tidlige livsstadier av torsk, hoppekreps, Stillehavsøsters, sjøpiggsvin og flerbørstemark, samt på hemocytter fra blåskjell. Subletale toksiske effekter av SS-utlekkingsløsninger ble videre undersøkt på individnivå hos juvenile blåskjell, mens den generelle og spesifikke toksisiteten til CTR-utlekkingsløsninger ble bestemt hos marine mikroalger. Totalt sett viste toksisitetsvurderingen av de fem utlekkingsløsningene at WG og SS hadde de høyeste effektene, mens utlekkingsløsningene fra PET-flaskene var minst toksiske. Flere kjemiske forbindelser som ofte finnes i plastpolymerer ble identifisert (f.eks. N-(1,3-Dimetylbutyl)-N'-fenyl-p-fenylendiamin), sammen med høye konsentrasjoner av sink. Generelt var tidlige livsstadier mer sensitive enn juvenile eller voksne organismer, og subletale effekter ble observert på flere biologiske nivåer under miljøforhold, selv ved lave konsentrasjoner. Den observerte toksisiteten var sterkt avhengig av den kjemiske profilen og utlekkingspotensialet til de tilknyttede kjemiske tilsetningsstoffene, noe som kan føre til arts-spesifikk følsomhet og fungere som et "tidlig varsel"-signal om mulig høyere dysfunksjon på populasjons- eller økosystemnivå.
For å skille mellom partikkel- og kjemisk toksisitet ble torskeyngel og voksne blåskjell eksponert for tre CTR-komponenter: utlekkede partikler, utlekkingsløsninger og opprinnelige partikler med kjemikalier. Utlekkede kjemikalier var de viktigste toksisitetsdriverne hos torskeyngel, mens det ble observert en synergistisk effekt mellom partikler og kjemikalier over tid hos blåskjell. Bioakkumulering og eliminering av CTR-partikler og utlekkingsløsninger i blåskjellvev viste at kjemiske tilsetningsstoffer akkumuleres over tid, spesielt i nærvær av partikler. Disse resultatene indikerer at kjemiske tilsetningsstoffer, snarere enn fysiske partikler, er de primære driverne for CTR-toksisitet, med partikler som spiller en mindre sekundær rolle ved potensielt forsterke toksisiteten av utlekkede kjemikalier. Likevel gjenstår det å fastslå den eksakte mekanismen, enten ved kjemisk passiv dosering eller en fysisk effekt.
Gjennom detaljerte kjemiske og toksikologiske vurderinger utført på marine arter, har MicroLEACH-prosjektet gitt verdifull innsikt i partikkel, kjemiske og toksikologiske profiler for hverdagslige forbrukerprodukter. De anbefalte utlekkingsprotokollene, doseringsmetodene, eksponeringsforholdene og de biologiske endepunktene vil bidra til mer presise risikovurderinger av plastpartikler i marine miljøer. Hovedbudskapet fra dette prosjektet er viktigheten av å vurdere både de kjemiske og fysiske komponentene i plast-/elastomerpartikler når deres økologiske påvirkning evalueres. MicroLEACH ble ledet av NIVA i tett samarbeid med den nasjonale partneren SINTEF Ocean og de internasjonale partnerne Vrije Universiteit Amsterdam (Nederland), University of Plymouth (Storbritannia) og University of Queensland (Australia).

Increasing amounts of microplastics (MPs) and associated chemicals, a result from degradation of marine litter, are one of the unknown threats to the marine environment. This project will investigate the long-term effects of MPs to a range of environmentally and commercially relevant marine species from the Norwegian environment and identify the importance of plastic chemical additives to the observable effects. To improve environmental relevance, studies will be conducted with irregular shaped MP particles and fragments generated by cryo-milling post-production and post-consumer MP using realistic and future predicted concentrations. A detailed characterisation of test materials will be conducted using state-of the-art methods in addition to leaching studies of plastic additive chemicals under environmentally relevant conditions (e.g. seawater, synthetic gut fluid). Through innovative approaches, the ecotoxicity studies will attempt to distinguish between long-term effects derived directly from MPs and those resulting from the associated additive chemicals to identify potential risks at the individual and ecosystem level. MicroLEACH will also study MPs uptake, accumulation and elimination routes in test species and determine the associated toxicokinetics to facilitate an improved interpretation of effect data. The project will culminate in a series of trophic transfer-level studies to investigate the potential for bioaccumulation/biomagnification of MPs and associated additives in a Norwegian marine food-web. In a final step, the experimental data will be used to identify test systems for future development of regulatory guidelines for effect assessment of MPs and additive chemicals. MicroLEACH will establish a communication platform towards multiple stakeholders to ensure dissemination of the knowledge generated, with a focus on public engagement, to increase awareness regarding marine litter and ensure a better protection and mitigation of the marine ecosystem.

0 projects

STIPINST-Stipendiatstillinger i instituttsektoren

Stipendiatstilling 1 NIVA (2020-2023)

Awarded: NOK 4.1 mill.

Project Period: 2020-2024

Location: Oslo

MARINTFORSK-MARINTFORSK

Microplastics: Long-term Effects of plastics and Additive Chemicals on marine organisms

Awarded: NOK 7.0 mill.

Project Period: 2019-2025

Location: Oslo