Back to search

FUGE-Funksjonell genomforskn.i Norg

Establishment of a SNP techology platform within an integrative genetics framework (sammenslåes med matprogram 153302/I10)

Awarded: NOK 45.9 mill.

Project Manager:

Project Number:

151924

Project Period:

2002 - 2009

Location:

Subject Fields:

Most phenotypic traits in salmon and other commercially important marine species associated with health, growth, meat quality, and capacity for utilising new food items, have complex and partly interconnected genetic and regulatory architectures. To ensur e a continuous reduction in production costs while being able to deliver highly competitive quality products in dynamic markets requires an understanding of the underlying mechanistic basis of these traits. This initiative by the Norwegian School of Veter inary Science, University of Oslo, Norwegian Radium Hospital, Institute of Aquaculture Research and the Agricultural University of Norway aims to provide the foundation for development of the tools necessary for achieving such an understanding. We will es tablish a high-throughput SNP technology platform for disclosing genetic variation in Norwegian salmon and cattle populations. This technology platform will in addition serve a regional and partly national role concerning SNP-analyses of human, animal and plant materials, and a pilot study documenting the feasibility of the chosen technological solution will be using human material. The information generated by the SNP platform will together with other experimental data and the unique Norwegian biobank data on cattle and salmon be exploited in a sophisticated computational biology setting involving state of the art techniques for QTL localization, dynamic virtual representation of genomes, detection, description and analysis of gene re gulatory networks, and mathematical description of metabolic systems. The program builds upon and complements the current Norwegian Salmon Genome Project. It will realise several of the stated key objectives of the FUGE initiative within marine research l ike establishment of a close collaboration between industry and the research community, ensuring Norway’s leading role in the understanding and utilization of commercially interesting aspects of the salmon genome, and provide a solid national foundation for research in marine functional genomics that are strategically important to Norway.

Funding scheme:

FUGE-Funksjonell genomforskn.i Norg

Thematic Areas and Topics

LTP2 Klima, miljø og miljøvennlig energiEnergiMarinPolitikk- og forvaltningsområderBransjer og næringerFiskeri og havbrukBransjer og næringerLandbrukPortefølje HavPolitikk- og forvaltningsområderLæring, skole og utdanningEnergiFornybar energi, bioPortefølje Energi, transport og lavutslippLTP2 Marine bioressurser og havforvaltningLTP2 Rettede internasjonaliseringstiltakPortefølje Industri og tjenestenæringerPolitikk- og forvaltningsområderSkog, landbruk og matGrunnforskningBioteknologiPolitikk- og forvaltningsområderFiskeri og kystPortefølje HelseLTP2 HavPolitikk- og forvaltningsområderHelse og omsorgLTP2 Utvikle fagmiljøer av fremragende kvalitetInternasjonaliseringMatMat - BlågrønnEtiske, juridiske og samfunnsmessige aspekterBransjer og næringerEnergi - NæringsområdeLTP2 Helse, forebygging og behandlingMarinHavbrukInternasjonaliseringUtgående mobilitet (utgår 2010)LTP2 Fagmiljøer og talenterLTP2 Muliggjørende og industrielle teknologierLTP2 Miljøvennlig energi og lavutslippsløsningerInternasjonaliseringInngående mobilitet (utgår 2010)Bransjer og næringerLTP2 Styrket konkurransekraft og innovasjonsevnePortefølje LivsvitenskapLTP2 Nano-, bioteknologi og teknologikonvergensUtviklingsarbeidHelseBransjer og næringerHelsenæringenLTP2 Et kunnskapsintensivt næringsliv i hele landetBransjer og næringerSkog og trebrukBransjer og næringerNæringsmiddelindustriInternasjonaliseringInternasjonalt vertskapLTP2 Fornyelse i offentlig sektorHelseBasal biomedisinsk forskningInternasjonaliseringInternasjonalt prosjektsamarbeidMatPolitikk- og forvaltningsområderMiljø, klima og naturforvaltningPortefølje Muliggjørende teknologierTjenesterettet FoUAnvendt forskningPortefølje Landbasert mat, miljø og bioressurser