Back to search

HAVBRUKS-Havbruk - en næring i vekst

Utvikling og implementering av markør-assistert/genomisk seleksjon for resistens mot lakselus og andre egenskaper i avlsmålet

Awarded: NOK 3.3 mill.

Project Number:

200551

Project Period:

2010 - 2014

Organisation:

Prosjektet skal legge grunnlaget for systematisk implementering av markør-assistert seleksjon(MAS) og genomisk seleksjon i Aqua Gen sitt avlsarbeide. Aqua Gen har fra før hatt stor suksess med implementering av en QTL (quantitiative trait locus) for resis tens mot virussykdommen IPN. Vi ønsker nå å videreføre dette arbeidet ved å ta i bruk MAS på flere egenskaper som allerede er i avlsmålet, samt på en ny og viktig egenskap (lakselus). Vi ønsker også å legge grunnlaget for implementering av genomisk selek sjon, en videreføring av MAS, for de samme egenskapene. Stamfisk fra Aqua Gen sin avlskjerne, årsklasse 1994-2008, vil bli genotypet på en SNP-chip nylig utviklet av CIGENE (7000 polymorfe SNPer). Genotypene vil bli kombinert med fenotyper, registrert på stamfisken selv eller på avkomsgrupper. Både en tilnærming basert på koblingsulikevekt (assosiasjonsstudie) og en basert på genetisk kobling vil bli brukt. Dette vil kunne avdekke QTL for tilvekst, tidlig kjønnsmodning, filetfarge, fettprosent, utnyttels e av vegetabilsk fôr, resistens mot ILA, IPN, furunkulose, piscirickettsiose, HSMB, samt mange andre egenskaper. I tillegg vil vi gjennomføre en smittetest for resistens mot lakselus. Registreringer fra denne testen vil bli kombinert med genotyper hos for eldre, som skissert over. Identifiserte QTL for lakselus vil deretter bli bekreftet/finkartlagt ved genotyping av dyr fra smittetesten. Vi vil også forsøke å avdekke gener som påvirker lakselusresistens ved resekvensering av dyr med dedusert QTL-genotype (utkast til helgenomsekvens på laksen skal være ferdig i 2010). Datasettet som genereres vil også egne seg godt for å beregne markøreffekter til bruk i genomisk seleksjon. Vi vil også optimalisere metodikk og infrastruktur med tanke på kostnadseffektiv utnyttelse av MAS og genomisk seleksjon i Aqua Gen, samt ta resultatbaserte beslutninger med tanke på valg av metodikk.

Funding scheme:

HAVBRUKS-Havbruk - en næring i vekst