Wild-Farmed- Viruses in wild and farmed fish in Norway, part 2

Det finnes et marint reservoar for både Infeksiøs lakseanemi-virus (ILAV) og Salmonid alphavirus (SAV), og dette fører til introduksjon av nye varianter av disse virusene inn i norsk fiskeoppdrett. For ILAV så skjer dette flere ganger årlig, mens det for SAV bare har vært 2 introduksjoner så langt. Laksefisk regnes som den største smittekilden for begge disse virusene, men marine fisk kan ikke utelukkes som en mulig smittekilde. Målet med prosjektet var å undersøke marine fisk for mulig påvisning av ILAV og SAV. Organmateriale fra 2716 fisk av 43 ulike fiskarter som allerede var samlet inn i del 1 av prosjektet ble videre undersøkt for disse virusene. Infeksiøs lakseanemivirus (ILAV) Alle 453 samleprøver (nyre, milt, hjerne fra 1-5 fisk) og 1186 gjeller fra 40 ulike fiskearter ble testet med rRT-PCR for ILAV uten noen positive funn. Gjeller ble valgt for å øke muligheten for påvisning av den lavvirulente HPR0 varianten som i hovedsak påvises i gjeller. Marine fisk som mulig smittekilde for ILAV til oppdrettslaks kan selvsagt ikke utelukkes ut i fra en slik begrenset studie, og mer grunnleggende studier vil være viktige for om mulig å finne den marine smittekilden. Salmonid alphavirus (SAV) De samme 453 samleprøvene (nyre, milt, hjerne) som tidligere er testet for VHSV og ILAV ble testet for SAV med rRT-PCR uten positive funn. Videre har vi testet 1091 hjerter, og på aller siste kjøring fikk vi et positivt funn av små mengder SAV i hjerte på en steinbit. Undersøkelse av resten av organene fra fisken viser at det bare er påvisbart SAV i hjertevev. Dette stemmer bra med funn i andre land der hjerte har vært mest infisert. Steinbiten med SAV ble fanget i Finnmark i 2009, og sekvensering viser at det er SAV-3. Det var en lokal epidemi av SAV-3 i Finmark i 2005-2008, og vi undersøker nå sekvensene videre for å studere slektskap mellom ulike SAV-3 påvisninger i Finnmark. Videre undersøkelser pågår for om mulig å avklare om steinbiten ble smittet fra laksen eller motsatt.

Samples from 2700 wild fish of 42 different fish species have been collected along the Norwegian coast from Varanger to Stavanger in 2009 - 2011. Part of the material has been tested for VHSV, PMCV and PRV with positive results. The aim of the present stu dy is to investigate the same material for Infectious salmon anemia virus (ISAV) and Salmonid alphavirus (SAV). When it comes to ISAV and SAV the main source of infection has mainly been other farmed fish, and focus on susceptible marine fish has therefor e been scarce. However new knowledge and new problems have lately made marine fish reservoirs more interesting. Low pathogenic strains of ISAV (HPRO) have been detected in high prevalence of both wild and farmed salmonids, and it has been hypothesised t hat these strains may transition into high pathogenic variants of the virus. Several reports conclude that knowledge on possible marine reservoirs for both high and low virulent ISAV is needed. Lately a new variant of SAV (marine SAV-2) have caused majo r problems in Norwegian salmon farming. Different isolates of marine SAV-2 are more heterogenic than SAV-3 and marine reservoirs are therefore more likely. Fish from part 1 of the project will be tested with real time RT-PCR for ISAV / SAV, and any dete ction of virus will be further characterised with both virological and epidemiological methods. We are lucky to have a very good project group with extensive knowledge on many research fields necessary for interpreting any findings of ISAV or SAV in the w ild fish. Any detections of virus will lead to many new questions that need to be addressed in further research. Testing of the already existing material provides a low cost opportunity as a first step into the field of marine reservoirs for ISAV and SAV.