End-to-End Data Analysis for Accessible Cancer Diagnosis Tests

Dagens kreft diagnose tester utnytter vanligvis ikke den nyeste teknologien. En ideell kreft diagnose test er tilgjengelig og billig, og den bruker medisinsk data og bilder tatt på sykehuset for best mulig resultat. Vi vil i dette prosjektet utvikle ende-til-ende data analyse løsninger for slike tester. Testene må også bli akseptert av folk flest. Vi vil derfor også lage etiske retningslinjer for genom tester i Norge. For å fokusere forskningen vil vi lage en tidlig stadie brystkreft test som kombinerer en patentert blod-basert test med testen som bruke av mammografi programmet i Norge. Hvis prosjektet lykkes vil vi gi ny vitenskapelig kunnskap, teknologi, og etiske retningslinjer som kan brukes til å forske på og utvikle nye diagnose tester for kreft og andre sykdommer.

Current cancer diagnosis tests do not fully utilize the potential of current biotechnology instruments and integrated bioinformatics analyses. There is therefore a need over the next 5-10 years to develop novel molecular data based diagnosis tests. An ideal cancer diagnostics test should support the following requirements: (i) the sampling equipment should be portable and cheap to use to make the test accessible to everyone, (ii) the data processing should be efficient to support complex analyses at a low cost, (iii) the test should integrate molecular data with image data to improve the sensitivity and specificity of the test, and (iv) the test should adhere to the ethical guidelines and expectation of the society in order to be accepted. In this phase we will finish the phase 1 activities, communicate the results, and prepare for new directions for the project.