KSP: A Norwegian BioGenome initiative: the initial Launch phase

Menneskelige aktiviteter, både direkte og indirekte inkludert global oppvarming og klimaendringer, utgjør en økende trussel mot økosystemer, biodiversiteten og matproduksjonen på jorda. På sikt vil dette påvirke den globale matforsyningen og de biologiske ressursene vi er avhengige av. Bevaring av arter og økosystemer er avgjørende for menneskehetens framtid. Hver organisme har et unikt genetisk fingeravtrykk som utgjør genomet (den totale mengden DNA), hvor all informasjon individet trenger for å overleve, samhandle med miljøet og reprodusere, finnes. En fullstendig kartlegging og forståelse av genomene til alle jordens organismer vil ikke bare gi oss grunnleggende ny innsikt i biologi og biomangfold, men også gi oss tilgang til naturens "verktøykasse" for fremtidig bioteknologi. Dette kan føre til utvikling og forbedring av matproduksjon, medisinsk behandling, legemidler, vaksiner, biodrivstoff og biomaterialer. Earth Biogenome Project (EBP) er et globalt, ideelt initiativ med mål om å sekvensere genomene til alle eukaryote organismer på jorda innen en periode på ti år. EBP-Nor er første fase av et norsk prosjekt under EBP-paraplyen. I denne fasen vil vi etablere konsortiet, fordele arbeidsoppgaver, og utvikle rutiner for innsamling av materiale, sekvensering, analyser, samt lagring og tilgjengeliggjøring av data internt i det nasjonale konsortiet. Konsortiet består av de største universitetene i Norge (UiO, NMBU, UiB, NTNU, Uni Nord og UiT), SINTEF, og ikke-akademiske institusjoner som REV Ocean, The Life Science Cluster, og ArcticZymes Technologies. I første fase vil vi samle inn arter og produsere høy-kvalitets referansegenomer for et begrenset antall arter (100-150) som et proof of concept og for å utvikle robuste protokoller. På lengre sikt er målet å skape et komplett genom for alle artene i Norge. Til nå har vi sekvensert over 100 arter som enten er ferdig satt sammen og annotert, eller er i prosess for å bli ferdig annotert. Ytterligere 50 arter har blitt samlet inn, og vil bli prosessert til ferdige genom innen avslutningen av prosjektet. Oppsummert har vi nå etablert infrastrukturen og vist at dette pilot-prosjektet kan gjennomføres av norske fagmiljø.

-

Biodiversity is increasingly threatened by human-related activities, directly and indirectly, which ultimately imperils both the global food supply and other biological resources that we depend upon. Therefore, understanding and preserving species and ecosystems are global imperatives for human survival and prosperity. Each organism and species on the planet has a unique "blueprint" encoded by its genome, i.e. its total DNA, which contains all the information that the species needs to survive, interact with its environment and reproduce. Knowing and understanding the complete DNA sequence of all species of life on Earth will not only provide fundamental new insights into biology, understanding biodiversity and transform our ability to tailor conservation of life, but also deliver a comprehensive view of nature’s toolkit for future biotechnology to provide humanity with food, medical treatment, drugs, vaccines, biofuels and biomaterials. The Earth BioGenome Project is a global non-profit initiative that aims to sequence and catalogue the genomes of all of Earth's 1.5 million currently described eukaryotic species over a period of ten years. EBP-Nor is the Norwegian initiative of EBP, and a partnership of the major universities in Norway (UiO, NMBU, UiB, NTNU, Uni Nord and UiT), the research institute SINTEF, and the non-academic institutions REVOcean, the Life Science Cluster, the Norwegian Environment Agency, and ArcticZymes Technologies. Together we will sequence and catalogue all eukaryotic species occurring in Norway, estimated to 45,000 species.