miRNA as biomarkers in early detection and personalized treatment in ovarian cancer

Epitelial eggstokkreft er en sykdom med relativt dårlig overlevelse. Det finnes ingen effektive strategier for tidlig oppdagelse, og tidlige symptomerpå sykdommen er uspesifikke (for eksempel oppblåsthet og hyppig vannlating). Den beste tilgjengelige blodbaserte biomarkøren for tidlig deteksjon for eggstokkreft er CA125, men denne markøren har begrenset evne til å skille mellom kvinner med sykdommen og de som ikke har kreft. Denne studien vil gi den nødvendige valideringen av et panel av microRNA for tidlig påvisning av epitelial eggstokkreft. Vi vil bruke serumprøver fra prospektive kohorter og kliniske biobanker. Målet er å validere et serologisk miRNA-panel som sammen med CA125 vil ha tilstrekkelig diagnostisk presisjon til å bli brukt som et verktøy,sammen med bildebehandling, til tidlig diagnose og henvisning av pasienter med mistanke om malignitet til persontilpasset spesialistbehandling. Vi vil: • Validere serum miRNA-profiler som biomarkører for tidlig påvisning i prøver samlet inn < = 3 år førdiagnose og matchede kontroller, og karakterisere kilder til variasjon i miRNA-profiler. • Evaluere miRNA-profiler i klinisk setting og diskriminering mellom pasienter med eggstokkreft, og kvinner med (i) godartede ovarietumorer og (ii) underliggende komorbiditeter (inkludert andre krefttyper). Videre vil vi evaluere serum miRNA-profiler som prediktorer for tilbakefall og vi vil sammenligne miRNA-profiler fra tumorvev med profiler fra serum. • Utvikle og optimalisere protokoller for dataintegrasjon og metoder for algoritmeutvikling. • Adressere etiske, juridiske og sosiale aspekter ("ELSA"), inkludert aktiviteter i viktige interessentgrupper. Utfordringer innen personvern og deling av helsedata, inkludert utvikling av en kunstig intelligensmodell, vil bli adressert, og det samme vil definisjonen av en "sunn" befolkning med hensyn til miRNA-profiler for eggstokkreft. I prosjektets første bevilgningsår har vi gjennomført følgende oppgaver: • Gjennomført kick-off møte i Oslo, inkludert alle prosjektpartnere og brukerrepresentanter. • Fullført konsortieavtalene på tvers av deltakende institusjoner. • Fullført prosjektets Data Management Plan. • Innhentet de nødvendige etiske godkjenningene for tilgang til de prøvematerialet og datakilder. • Identifisert utvalget av prøver og data fra de prospektive og kliniske biobankene. • Optimalisert analysemetodene for miRNA-analysene ved bruk av digital PCR (dPCR), med prøveanalyse som skal fullføres gjennom prosjektår 2. Dette krevde spesiell vurdering gitt de unike egenskapene til biobankbaserte prøvermateriale, særlig de som har vært langtidslagret. • Presentert design og konsept for miRPOC-prosjektet med en poster «microRNA as biomarkers in early detection and personalized treatment in ovarial cancer: Utvikling av miRPOC-konsortiet» på American Association for Cancer Research Ovarian Cancer Symposium (Boston, USA; oktober 2023). • Igangsatt ELSA-aktiviteter med fokus påutfordringer innen datadeling på tvers av landegrenser og hvordan vi kan finne løsninger for prøve- og datadeling mellom samarbeidspartnere. Ytterligere ELSA-relaterte aktiviteter inkluderte brukerorientert Formidling: o Dr. Hilde Langseth og Dr. Renée Fortner ble omtalt i Afrodite, magasinet til Gynkreftforeningen , og beskrev deres studier på biomarkører for tidlig deteksjon av eggstokkreft (Edition 1/2024). o Dr. Langseth presenterer "Biomarkører for tidlig påvisning av kreft - eksempler fra pågående forskning i Janus biobank" for Gyn kreftforening (Oslo; januar 2024). o Dr. Fortner presenterer “MicroRNA as biomarkers in early detection and personalized treatment in ovarian cancer: Development of a personalized prevention consortium” på Nordic Conference on Future Health (Trondheim, september 2024) Prosjektet vil gå videre med prøveforberedelse og dPCR-analyser på materialet, implementere dataintegrerings- og metodeutviklingskomponenten i prosjektet. Vi planlegger også flere ELSA-relaterte aktiviteter.

Epithelial ovarian cancer (EOC) is a lethal malignancy with poor survival. There are no effective early detection strategies, and early symptoms are vague. This study will provide validation of a miRNA panel for EOC early detection in serum samples from prospective cohorts, paired with clinical data and biospecimens. The project is organized as a consortium, where the collaborators are leading the Prospective Early Detection Consortium for Ovarian Cancer. We have used next generation sequencing to identify and validate a miRNA panel. The panel was developed and validated in patients with benign and malignant pelvic masses; and was further validated on a subset of patients and in silico. We have shown that the expression of circulating RNAs varies between healthy individuals and by age, sex, and lifestyle factors. Sources of variation in miRNA levels and the impact of confounders on discrimination between cases and non-cases must be evaluated. We plan to validate a serologic miRNA panel that, together with CA125, would have sufficient diagnostic discrimination for early-stage disease to be used clinically together with imaging, would allow early diagnosis and streaming of patients with suspected malignancy to personalized care. Toward that objective we will: -Validate serum miRNA profiles as biomarkers for EOC early detection in samples collected <=3 years before diagnosis and controls and characterize sources of variation in miRNA profiles. -Evaluate miRNA profiles in the clinical setting and the discrimination between EOC cases and (i) women with benign ovarian tumors in blood samples and (ii) women with underlying comorbidities. We will also evaluate miRNA profiles as predictors of recurrence and compare tumor tissue and serum miRNA profiles. -Develop and optimize protocols for data integration and methods for algorithm development and direct in silico validation. -Evaluate Ethical, Legal and Social Aspects (ELSA) of implementation in key stakeholder groups.