ABI 3100 Genetic Analyzer til påvisning av genetiske polymorfismer (SNPs)

Vi ønsker å etablere en high-throughput SNP genotypingsteknologi ved instituttet og vil i den forbindelse satse på en enkel nukleotid ekstensjon teknologi med avlesning på automatisk sekvensator (ABI 3100). Det ser ut til at det er denne kjemien som har v unnet frem som den mest velegnete, og vi har allerede med hell prøvd ut metoden. Instituttets behov for analyser utført på automatisk sekvensator er generelt dramatisk økende. Vi har per i dag en ABI 1377 XL DNA Sequencer til dette arbeidet. I tillegg benytter vi tilsvarende instrument på Mikrobiologisk avdeling. Begge instrumentene er meget overbelastet med tre ukers ventetid for å få tilgang. Flere forskningsprosjekter lider under at fremdriften begrenses pga. manglende tilgang på DNA sekvensator analyser til påvisning av polymorfismer. En ABI 3100 har åtte ganger økt kapasitet i forhold til en ABI 1377 XL, og vil dermed kunne imøtekomme vår stadig økende antall brukere og bruksområder. ABI 3100 kan brukes til en rekke ulike genanalyser, som fragmentlengdeanalyser (mikrosatellittanalyse r), SNP genotyping og direkte sekvensering. Det faktum at instrumentet er så allsidig med hensyn til bruksområder er svært fordelaktig, fordi man har et anvendbart instrument uavhengig av svingningene i hvilken metodologi som brukerne ønsker å utføre.