Deteksjon og kvantifisering av patogener (Sirococcus conigenus og Gremmeniella abietina) i småplanter ved bruk av "multiplex real-time PCR"

De siste 2-3 årene har mane planteskoler hatt problem med ringing og avdøing av granplanter. Infeksjon skjer i løpet av vekstsesongen. Sjukdomsutviklingen kan være litt forskjelligartet. I noen tilfeller utvikler småplantene ensidige barknekroser på stamm en og svake symptomer kan observeres i løpet av vekstsesongen, i andre tilfeller er skaden synlig først etter overvintringen på lager eller ute i skogen. Om høsten, når plantene sorteres for å settes på kjølelager eller selges for høstplanting, er det van skelig å oppdage disse skadene siden avdøingsprosessen som regel ikke har kommet så langt at det er synlige skader. I enkelte tilfeller vil ringingen medføre hel avdøing av planter, i andre tilfeller vil soppskadene forårsake topptørke. Med dette prosjektet ønsker vi å utvikle en metode som ville gjøre det mulig å bestemme om skadelige organismer er til stede i vertsplanten uansett tidspunktet for prøvetaking. Den nyutviklede metoden, ”real-time PCR”, gjenkjenner DNA strukturen hos de fo rskjellige organismene. Målet er å utvikle en praktisk, rask og nøyaktig metode som gir svar på spørsmålet om patogene sopper som Sirococcus conigenus og Gremmeniella abietina finnes i plantevevet uavhengig om de har dødd ut eller fremdeles er i live. Den ne metoden bør også gi svar på mengde av soppmaterialet (hyfer) som er tilstede i det infiserte vevet.