Molekylærbiologisk assistert stadium-inndeling av kolorektal cancer

Innenfor de klinisk-patologiske stadiene Dukes B og C av kolorektal cancer (CRC) overlever kun halvparten 5 år. Det er derfor av stor betydning å kunne identifisere molekylære markører som kan forutsi sykdomsforløpet. CRC kan inndeles i to grupper relater t til genomisk ustabilitet. Majoriteten viser store kromosomale feil (CIN, chromosomal instability) og en mindre gruppe (ca. 15%) har defekt reparasjonssystem som forårsaker mikrosatelitt ustabilitet (MSI). For MSI gruppen håper vi at ulikt mutasjonsspekt eret for ca. 30 selekterte gener vil kunne relateres til godt eller dårlig sykdomsforløp innenfor denne gruppen. Prosjektet vil bruke cDNA mikromatriser for å identifisere ekspresjonsprofiler for CIN svulster i hver av Dukes B og C gruppene. Prosjektgrup pen antar at disse profilene vil være forskjellige mellom pasienter med god versus dårlig prognose innenfor hver gruppe. Basert på disse data vil ett sett av kandidate gener bli klinisk validert ved hjelp av in situ proteinekspresjons-studier på ve vsmikromatrise med 400 tumorprøver.