NAERINGSPH-Nærings-phd

Mikrober kan spise mye forskjellig, til og med råolje og metaller. I oljetanker, hav, jord og nede i oljereservoarer kan man finne bakterier som bruker oljen og metaller som mat. Fra vårt ståsted kan de være nyttige om de bryter ned tunge oljemolekyler til mindre komponenter vi lettere kan utnytte energien fra eller spiser metaller slik at vann kan renses på en smartere måte. Enkelte parasitter kan transporteres i vann og overleve lenge om de kapsler seg inn som cyster. Noen få cyster kan være nok til å gjøre oss syke dersom vi drikker vann som inneholder disse. Å påvise disse parasittene i drikkevann vil være lettere om man kan oppkonsentrere dem før prøven blir analysert. Da vil man få en mer sensitiv deteksjon. I dette prosjektet utvikles en analyseløsning for å kunne detektere disse organismene. Systemet består av to deler: en for å forbehandle prøven; og en for molekylærbiologisk analyse. Forbehandlingen består av Trilobites hydrodynamiske teknologi for partikkelseparering. Denne brukes for å skille ut og konsentrere opp mikroorganismene. Analysedelen er basert på nukleinsyreisolering og NASBA. NASBA er en isoterm metode for å kopiere bestemte gensekvenser. Det har blitt utviklet sett med primere og prober for å finne og påvise bakteriene. Primere rammer inn bestemte RNA-sekvenser, og prober med molekylære lykter gir fluoriserende signal. Disse er spesifikke for bakteriene, og binder kun til helt bestemte RNA-sekvenser. Vi har allerede laget flere slike lovende sett og testet dem på mikrobene. Slike primer- og probesett kan også utvikles for å detektere andre mikroorganismer i prøver som kan konsentreres i Trilobites mikrochiper, slik som vannbårne parasitter. Dette næringsPhD-prosjektet har fokusert på den biologiske delen til nå og vil fortsette med et økt fokus på forbehandling av prøven med Trilobite sin teknologi for separasjon av partikler. Her lages det en enhet for automatisk å ta ut en del av mediet som skal testet og bearbeide dette til en representativ prøve for analyse.

Statoil's research center in Trondheim, in collaboration with SINTEF Materials and Chemistry among the most important institutions in Norway for studies of hydrocarbon-eating micro-organisms related to oil drilling, production and refining. SINTEF and Sta toil have together acquired much knowledge and experience related to what these microbes are, what properties they have and the communities they live in. There has been established a large strain collection of oil-eating micro-organisms isolated from a va riety of hydrocarbon sources. The opportunity has been created for a number of new inventions and useful technology that can increase profitability across the value chain of production of oil. NorChip AS, together with SINTEF (Mina Lab) and Vestfold Univ ersity College, is the most important institutions in Norway that can create and produce usable biological or chemical micro-and nano-system platforms. SINTEF (Mina Lab), Vestfold University College and the central German institutes (IMM and IMTEK), toget her with NorChip AS has developed important biological micro-and nano-systems that represents a key technology platform POCNAD that is under industrialization. The POCNAD technology is now oriented towards the accurate detection of at least 16 different R NA (mRNA, or microRNA 16SRNA) that is specific genotypic against any gene activity in bacteria or other organisms. POCNAD is now ready to be used by a doctoral candidate. Microrefining system and micro-optical devices have already been developed by Hive, Trilobite Microsystems AS and NorChip AS. Techni AS from Borre is an important player in terms of reducing cost and time until the finished products, in particular against the micro-and nanotechnology, and the Techni AS is responsible for developing a sam pler system that can be used to take samples from the fermentor/tank/seabed. ISentio AS has developed a complete software and database systems that will make the bioinformatics work available.