CHARGE-COMBINATION DESIGN OF TARGETING PEPTIDES FOR TREATMENT OF CANCER.

Brystkreft er blant verdens mest aggressive og utbredte patologier, med særlig prevalens i vestlige land (Althuis et al., 2005). Anvendelse av kjemoterapi og klassisk syntetisk medisin inkluderer en serie bivirkninger, og behandlingen kan ofte resultere i dype traumer i pasienten. Nyere studier fra Fjordforsk AS på markører og signalveier i kreftutvikling har vist at flere biokjemiske baner som fører til utløsning av kreft har funksjoner relatert til oksygenmangel, mangel på signal-peptider og dysfunksjon av samspillet mellom proteiner og DNA (Manzetti and Tzamneti, 2013). Molekylære dynamikk simuleringer er en høy-hastighets datamaskinsberegningsmetode som er svært nyttige for å fremstille nye alternativer for behandling, på grunnlag av deres omfattende kapasitet for å identifisere spesielle lommer for mottak på overflaten av proteiner. De mottagende «lommer» på proteiner er et av de viktigste måtene å skjelne mellom viktige proteiner i karsinogen utvikling fra vitale proteiner i kroppen. For å utføre en målrettet behandling på en ny måte, har det blitt utviklet en algoritme hos Fjordforsk AS til å arrangere kombinasjoner av ladninger i peptidesekvenser til å overlappe proteiners overflater (Manzetti, 2003). I PEPTODYN vil denne algoritmen benyttes i Fjordforsk AS høyhastighets datamaskin og sammen med partner, utføre syntese og testing av de resulterende forbindelsene på kreftceller. Resultatet av EUROSTARS prosjektet, hvis innvilget, er en cocktail av 3-5 sekvenser med optimale inhiberingseffekter på kreftceller, generert fra høyhastighetsdatamaskin i kombinasjon med in vitro syntese for kommersiell utvikling med partnere og sykehussektoren.