Elucidating critical factors for establishing an efficient breeding program for Atlantic halibut

Atlanterhavskveite (Hippoglossus hippoglossus) er en ettertraktet matfisk, men på grunn av overfiske er bestanden kraftig redusert. I de siste årene har produksjon av atlanterhavskveite vist en positiv trend, men nivået er fortsatt lavt. Dette skyldes i hovedsak mangelen på avlsprogram. Kommersielt oppdrett av andre akvatiske arter har vist at et avlsprogram øker produksjonseffektiviteten betraktelig. Det er derfor ønskelig å evaluere om det er mulig å etablere et avlsprogram for atlanterhavskveite. Målet med et effektivt avlsprogram er å opprettholde genetisk diversitet for å forhindre innavl. Etablering av et avlsprogram krever en avlskjerne med tilstrekkelig genetisk diversitet. Det planlegges derfor å kartlegge den genetiske diversiteten i stamfisken til fire forskjellige selskaper. Videre skal det etableres et avlsmål og en strategi for registrering og seleksjon av ønskede produksjonsegenskaper. Avlsstrategien og utvelgelsen av egenskaper vil baseres på eksisterende og vedvarende utfordringer i produksjonsløpet. Sammenlignet med arter innen terrestrisk landbruk er mange akvatiske arter svært fruktbare og masse gytere, noe som fører til utfordringer i et avlsprogram. For å kunne velge riktig avlsprogramstrategi for atlanterhavskveite, vil de to vanligste avlsprogramstrategiene evalueres: 1. Et familie basert avlsprogram er et tradisjonelt avlsprogram som opprettholder genetisk diversitet gjennom uavhengige familie linjer. 2. Sporing og identifisering av familier ved bruk av genetiske markører, inkludert mikrosatelitter og singel nukleotid polymorfisme (SNP) paneler har vist seg å være et effektivt alternativ.

Atlantic halibut is traditionally a highly valued food fish, but due to overfishing and subsequent stock collapses it has become scarce. The production of Atlantic halibut has shown a positive trend in recent years but still remains at a low level. The main reason for this low level is the lack of breeding programs available for halibut. As we know from Atlantic salmon, breeding has increased the production efficiency substantially. Thus, we want to evaluate if it is possible to establish a breeding program for Atlantic halibut as well. Establishment of a breeding program requires a founder population with sufficient genetic diversity. Therefore, during this project we are planning to determine genetic diversity in the brood stock populations of company A, B and C. Further, we need a breeding goal and a plan for how to register and select desirable production traits and these we will do based on persisting challenges in the production cycle. In order to choose the right breeding strategy we will evaluating two breeding programs: 1. Family based breeding program and 2. Trace and identify families with the use of genetic markers, including microsatellites and SNP panels During this project we are planning to answer the following questions: 1. Is there sufficient genetic variation in the brood stock pool to establish a breeding program for company A, B and C? Are there sufficient sibling groups that can be tested on? Is relative genetic uniformity necessarily a disadvantage? 2. What should be the breeding goal? Are there significant SNP explaining the majority of genetic variation of the following traits? Do individuals in relative uniform pops exhibit extreme phenotypes for certain trait? 3. What is the right breeding strategy? 1)Family based with 300 families or 2)Trace and identify families with the use of genetic markers What are the practical and economic consequences of choosing 1 or 2? What is the profitability of the breeding program?